Онкогеномика. Мастер-класс проф. Д.В. Залетаева
Генетические маркеры
Микросателлитная нестабильность
Следствием повышенной частоты возникновения мутаций в геноме является микросателлитная нестабильность, которая, в первую очередь, связана с нарушением системы репарации ДНК. Легко выявляемая микросателлитная нестабильность в ряде случаев может служить признаком инициации опухолевого процесса. В опухолевых клетках появляются дополнительные аллели микросателлитов, которые отличаются по длине от аллелей в нормальных тканях того же больного, при изменении длины микросателлитных последовательностей в результате делеции или вставки нескольких нуклеотидов. Если повреждено больше 30% исследуемых микросателлитов, что считается высоким уровнем микросателлитной нестабильности, то опухоль имеет replication error- positive phenotyp (RER+ фенотип) и значит в ДНК её клеток накопились сотни и тысячи мутаций в микросателлитных последовательностях.
Ни при одной нозологической форме не отмечается столь частого возникновения микросателлитной нестабильности, как при новообразованиях толстого кишечника. RER+ фенотип характерен для 70-100% синдрома Линча и ассоциирован с инактивацией генов, контролирующих репарацию неспаренных оснований. Вероятно, это связано с высочайшим пролиферативным потенциалом клеток на дне кишечных крипт, что ведёт и к увеличению ошибок репликации.
В 13-15% рака толстой кишки, желудка и эндометрия нестабильность микросателлитов обусловлена нарушением функции генов репарации неспаренных оснований – MSH2, MLH1, PMS1 и PMS2.
При МРЛ в ДНК плазмы крови больных и в моче при новообразованиях мочевого пузыря обнаруживается RER+ фенотип.
Как и для детекции микроделеций, для выявления микросателлитной нестабильности используется микросателлитный анализ.